1/- Giải thích rõ khu phi thuế quan:
Theo Thông tư số 32/2007/TT-BTC thì chỉ đề cấp khu phi thuế quan nhưng không giải thích cụ thể.
Nay theo Thông tư số 30/2008/TT-BTC quy định, khu phi thuế quan bao gồm: khu chế xuất, doanh nghiệp chế xuất, kho bảo thuế, khu bảo thuế, kho ngoại quan, khu kinh tế thương mại đặc biệt, khu thương mại – công nghiệp và các khu vực kinh tế khác được thành lập theo quyết định của Thủ tướng Chính phủ. Quan hệ mua bán, trao đổi hàng hóa giữa các khu này với bên ngoài là quan hệ xuất khẩu, nhập khẩu.
2/- Dịch vụ cung cấp cho doanh nghiệp chế xuất sử dụng cho tiêu dùng cá nhân:
Theo Thông tư số 32/2007/TT-BTC, dịch vụ cung cấp cho doanh nghiệp chế xuất sử dụng cho tiêu dùng cá nhân như: dịch vụ vận chuyển đưa đón công nhân, cung cấp suất ăn... không được áp dụng thuế suất thuế GTGT 0%.
Nay theo Thông tư số 30/2008/TT-BTC thì dịch vụ cung cấp cho doanh nghiệp chế xuất như: dịch vụ vận chuyển đưa đón công nhân, cung cấp suất ăn... được áp dụng thuế suất thuế GTGT 0%.
3/- Thủ tục hải quan đối với hàng hóa dịch vụ cung cấp cho doanh nghiệp chế xuất:
Theo Thông tư số 32/2007/TT-BTC, cơ sở kinh doanh bán hàng hóa như văn phòng phẩm, lương thực, thực phẩm, hàng công nghệ phẩm cho doanh nghiệp chế xuất thì phải có tờ khai hải quan về hàng xuất khẩu mới được áp dụng thuế suất thuế GTGT 0%.
Nay Thông tư số 30/2008/TT-BTC quy định, cơ sở kinh doanh cung cấp điện, nước, văn phòng phẩm, hàng hóa phục vụ sinh hoạt hàng ngày của doanh nghiệp chế xuất thì không phải làm thủ tục hải quan. Riêng đối với văn phòng phẩm, hàng hóa phục vụ sinh hoạt hàng ngày của doanh nghiệp chế xuất thì cơ sở cung cấp chỉ cần đăng ký với các Ban quản lý Khu chế xuất, Khu công nghiệp, Khu công nghệ cao, Khu kinh tế, Khu thương mại thì được áp dụng thuế suất thuế GTGT 0%.
4/- Đối với hàng hóa dịch vụ dùng để khuyến mại, quảng cáo, hàng mẫu phục vụ cho sản xuất, kinh doanh:
Theo Thông tư số 32/2007/TT-BTC thì phải lập hóa đơn GTGT trên hóa đơn ghi đầy đủ các chi tiêu và tính thuế GTGT như hóa đơn xuất bán hàng hóa cho khách hàng.
Nay Thông tư số 30/2008/TT-BTC quy định, chỉ lập hóa đơn, trên hóa đơn ghi tên và số lượng hàng hóa, ghi rõ là hàng khuyến mại, quảng cáo, hàng mẫu không thu tiền không phải tính thuế GTGT nên dòng thuế GTGT không ghi, gạch chéo.
5/- Đối với hàng hóa dịch vụ tiêu dùng nội bộ:
Theo hướng dẫn tại Thông tư số 32/2007/TT-BTC, hàng hóa, dịch vụ tiêu dùng nội bộ phục vụ cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT thì lập hóa đơn nhưng không ghi thuế GTGT (dòng thuế không ghi gạch chéo).
Nay hướng dẫn tại Thông tư số 30/2008/TT-BTC quy định, đối với hàng hóa, dịch vụ tiêu dùng nội bộ không phân biệt có phục vụ sản xuất kinh doanh hàng hóa dịch vụ chịu thuế GTGT hay không chịu thuế GTGT đều phải lập hóa đơn GTGT (hoặc hóa đơn bán hàng), trên hóa đơn ghi đầy đủ các chỉ tiêu và tính thuế GTGT như hóa đơn xuất bán hàng hóa, dịch vụ cho khách hàng.
6/- Đối với cơ sở kinh doanh nhận tiền tài trợ của các cơ sở kinh doanh khác:
Theo Thông tư số 32/2007/TT-BTC, khi nhận tiền tài trợ nếu khoản tài trợ này để thực hiện các dịch vụ phục vụ cho bán sản phẩm của bên tài trợ thì lập hóa đơn GTGT tính thuế GTGT theo quy định. Trường hợp khoản tài trợ này không liên quan đến việc bán sản phẩm của bên tài trợ thì không tính thuế GTGT, chỉ lập chứng từ thu tiền.
Hiện nay theo Thông tư số 30/2008/TT-BTC, khi nhận tiền cơ sở kinh doanh lập chứng từ thu (không phân biệt nhận tiền tài trợ có liên quan hay không liên quan đến việc bán sản phẩm) và xác định là khoản thu nhập khác để kê khai và nộp thuế TNDN theo quy định.
7/- Khấu trừ thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ hình thành tài sản cố định dùng vào mục đích phúc lợi:
Theo Thông tư số 32/2007/TT-BTC thì thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ hình thành tài sản cố định dùng vào mục đích phúc lợi của cơ sở kinh doanh không được khấu trừ mà tính vào nguyên giá của tài sản cố định.
Nay Thông tư số 30/2008/TT-BTC quy định, thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ hình thành tài sản cố định của doanh nghiệp như nhà ăn ca, nhà nghỉ giữa ca, nhà ở miễn phí, phòng thay quần áo, nhà để xe, nhà vệ sinh, bể nước phục vụ cho người lao động làm việc trong khu vực sản xuất, kinh doanh và nhà ở, trạm y tế cho người lao động làm việc trong các khu công nghiệp được khấu trừ toàn bộ.